nature-experiment-log

experiment-log — 实验日志标准化

输入方式

用户通过以下任一方式提交实验原始材料时自动加载：

• 直接上传 — 在当前会话提交图片、音频、语音转录或文字。
• 本地材料 — 提供本地文件或文件夹路径，由 agent 读取并整理。
• 飞书群 — 通过可选的 feishu-cli-integration 读取群消息和附件。

输出方式

• 本地 Markdown — 将日志和原始附件保存到用户指定的普通本地文件夹；未指定目录时，先返回可保存的 Markdown，不擅自选择路径。
• Obsidian vault — 通过可选的 obsidian skill 写入 vault，并使用附带模板建立索引、异常记录和设备追踪。

核心流程不要求安装飞书或 Obsidian。使用飞书群输入时，才需要 bot 已加入目标群并具备 im:message、im:message.group_msg 和 im:resource 权限。

处理流程

1. 接收上传材料、读取本地文件，或从已配置的飞书群获取材料。
2. 通过 vision_analyze 和文本解析提取结构化信息。
3. 对缺失或模糊字段向用户确认，不猜测实验条件或结果。
4. 确认输出方式和目标目录，生成实验 ID 与样品批次 ID。
5. 写出 {OUTPUT_ROOT}/实验日志/{体系}/{类型}/{exp_id}.md。
6. 将原始附件归档到 {OUTPUT_ROOT}/raw/experiments/YYYY.MM.DD_描述_EXPID/，并在日志中建立引用。
7. 如启用索引模板，更新实验索引；发现异常时追加异常记录。
8. 告知用户生成文件及原始材料的具体位置。

模糊信息（温度记不清、样品编号不明）主动询问，不猜测写入。

目录结构

/vault/
├── raw/experiments/                       ← 原始层（归档）
│   └── YYYY.MM.DD_描述_EXPID/
│       ├── 笔记.md
│       ├── 图片/
│       └── 语音/
│
wiki/实验日志/                              ← 标准层（产出）
├── 实验索引.md
├── 异常记录.md
├── {体系A}/
│   ├── 实验类型1/
│   ├── 实验类型2/
│   └── ...
├── {体系B}/
│   └── ...
└── 公共/
    └── 设备与试剂追踪.md

实验 ID 规则

样品批次 ID 规则

同一批样品跨多个实验时 sample_batch 保持一致，便于 dataview 追踪。

设备代码

按实际设备扩展。

可选的 Obsidian 集成

本 skill 可以只向普通本地文件夹输出 Markdown，也可以与 Obsidian vault 配合使用。Obsidian 是一个基于本地 Markdown 文件的笔记系统，配合 Dataview 插件可实现实验数据的动态查询和仪表盘。

为什么用 Obsidian：

• 所有日志为纯文本 Markdown，可版本控制、可全文搜索
• YAML frontmatter 结构使 dataview 可自动生成实验列表、异常汇总、设备使用记录
• 本地存储，无云依赖性，数据安全

安装 skill 后需在 vault 中创建以下文件：

将模板文件复制到你的 Obsidian vault 对应位置即可使用。

参考示例

references/ 目录包含三个完整的实验日志示例，覆盖常见实验类型：

每个示例均包含完整的 YAML frontmatter 和 Markdown 正文，可直接作为模板修改使用。

可选的飞书 CLI 集成

需要从飞书群获取材料时，使用 feishu-cli-integration skill：

• 拉消息：lark-cli im +chat-messages-list --chat-id oc_*** --page-size 30 --sort asc
• 下载图片：lark-cli im +messages-resources-download --message-id *** --file-key *** --type image --output <相对路径>
• ⚠️ --output 只接受相对路径，先 cd 到 raw/experiments/ 归档目录

群 ID 和 bot 权限按 feishu-cli-integration skill 的配置获取。

自定义指南

• 体系代码：按你的实验体系自定义（如 CL/NO/OR/PO）
• 实验类型：在 wiki/实验日志/{体系}/ 下按需创建子目录
• YAML 字段：模板是建议结构，可增删字段
• 设备代码：按实际实验室设备扩展
• 输出根目录：可以是普通本地文件夹，也可以是 Obsidian vault 根目录

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